プレバイオティクスであるイソマルトオリゴ糖を分解する細菌酵素の立体構造を解明 国立大学法人 静岡大学のプレスリリース
静岡大学グリーン科学技術研究所 生物分子機能研究コア／農学部の宮崎剛亜准教授の研究グループは、プレバイオティクスとして知られるイソマルトオリゴ糖を分解する細菌由来酵素の分子構造を解析し、イソマルトオリゴ糖のα-1,6結合を特異的に認識してグルコースに分解する仕組みを原子レベルで明らかにしました。・本研究成果は細菌の糖質資化性の予測やその機構解明に寄与することが期待されます。
当研究グループは以前、乳酸菌が菌体外多糖（EPS）として産生する多分岐デキストランを対象とした土壌細菌Flavobacterium johnsoniae の多糖資化機構を解明しました。その中から見出されたイソマルトオリゴ糖分解酵素（FjGH97A）は、腸内細菌Bacteroides thetaiotaomicron...
膨大なゲノム情報から見出された機能未知タンパク質・酵素の機能は、機能が明らかになっているタンパク質・酵素とのアミノ酸配列相同性の高さに基づいて予測されます。本研究によって、糖質分解酵素のアミノ酸配列の相同性だけでなく、基質結合部位のアミノ酸残基に着目した基質特異性予測や酵素が関わる細菌の糖質資化機構の予測・解明に貢献できると考えられます。静岡大学グリーン科学技術研究所 准教授・宮崎 剛亜（みやざき たかつぐ） 本研究は、自然科学系教育部バイオサイエンス専攻博士課程修了生である中村駿太郎博士が中心となって遂行した乳酸菌EPS資化機構の研究から派生してアイディアが構築され、本学大学院総合科学技術研究科農学専攻修士課程修了生である倉田陸矢氏と一緒に重要な実験データを積み重ねたものになります。ヒトが消化酵素によって食物に含まれる澱粉を分解してグルコース（ブドウ糖）にして吸収するように、細菌も澱粉などの糖質を分解してエネルギー源を得ています。当研究グループは以前、プレバイオティクスと報告されている乳酸菌EPSの一つである多分岐デキストランを資化するための遺伝子座（図1）を土壌細菌Flavobacterium johnsoniaeから見出し、その遺伝子座にコードされる糖結合タンパク質や糖質加水分解酵素の機能や立体構造を明らかにしました（Nakamura et al., J. Biol. Chem.
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